Cílem Etického kodexu zaměstnanců FNKV je poskytnout zaměstnancům FNKV zásady k správnému řešení konkrétních eticky exponovaných nebo komplikovaných situací, získat, udržet a prohloubit důvěru veřejnosti v řízení FNKV. Dále pak stanovit principy a pravidla etického jednání zaměstnanců, ať již vně FNKV nebo vůči sobě navzájem, zakotvit zásady profesionálního postupu, posílit profesní identitu a odpovědnost zaměstnanců a nastavit normy sloužící k hodnocení osob.
S tímto kodexem jsou seznámeni všichni noví zaměstnanci FNKV a je nutné ho povinně dodržovat. Jeho obsah je prezentován i v rámci pravidelných školení, která zajišťují vedoucí zaměstnanci pracovišť.